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鼠疫生态涉及多种哺乳动物宿主和跳蚤。人们熟悉的城市鼠类只是系统的一部分。
生态、季节与人类聚居共同作用，使马达加斯加成为全球最重要的鼠疫地区之一。
鼠疫如何从港口城市鼠群进入西部野生动物，以及为何现代美国病例通常散发于乡村地区。